- a -
- c -
- f -
- g -
- i -
- m -
- r -
- s -
- setCategoryRates()
: beagle.Beagle
- setCategoryWeights()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- setEigenDecomposition()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- setPartials()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- setPatternWeights()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
, beagle.GeneralBeagleImpl
- setStateFrequencies()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- setTipPartials()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- setTipStates()
: beagle.Beagle
, beagle.GeneralBeagleImpl
, beagle.BeagleJNIImpl
- setTransitionMatrix()
: beagle.Beagle
, beagle.BeagleJNIImpl
- u -